EM算法
EM 的英文是 Expectation Maximization,所以 EM 算法也叫最大期望算法。
我们先看一个简单的场景:假设你炒了一份菜,想要把它平均分到两个碟子里,该怎么分?
很少有人用称对菜进行称重,再计算一半的分量进行平分。大部分人的方法是先分一部分到碟子 A 中,然后再把剩余的分到碟子 B 中,再来观察碟子 A 和 B 里的菜是否一样多,哪个多就匀一些到少的那个碟子里,然后再观察碟子 A 和 B 里的是否一样多……整个过程一直重复下去,直到份量不发生变化为止。
你能从这个例子中看到三个主要的步骤:初始化参数、观察预期、重新估计。首先是先给每个碟子初始化一些菜量,然后再观察预期,这两个步骤实际上就是期望步骤(Expectation)。如果结果存在偏差就需要重新估计参数,这个就是最大化步骤(Maximization)。这两个步骤加起来也就是 EM 算法的过程。
EM 算法的工作原理
说到 EM 算法,我们先来看一个概念“最大似然”,英文是 Maximum Likelihood,Likelihood 代表可能性,所以最大似然也就是最大可能性的意思。
什么是最大似然呢?举个例子,有一男一女两个同学,现在要对他俩进行身高的比较,谁会更高呢?根据我们的经验,相同年龄下男性的平均身高比女性的高一些,所以男同学高的可能性会很大。这里运用的就是最大似然的概念。
最大似然估计是什么呢?它指的就是一件事情已经发生了,然后反推更有可能是什么因素造成的。还是用一男一女比较身高为例,假设有一个人比另一个人高,反推他可能是男性。最大似然估计是一种通过已知结果,估计参数的方法。
那么 EM 算法是什么?它和最大似然估计又有什么关系呢?EM 算法是一种求解最大似然估计的方法,通过观测样本,来找出样本的模型参数。
再回过来看下开头我给你举的分菜的这个例子,实际上最终我们想要的是碟子 A 和碟子 B 中菜的份量,你可以把它们理解为想要求得的模型参数。然后我们通过 EM 算法中的 E 步来进行观察,然后通过 M 步来进行调整 A 和 B 的参数,最后让碟子 A 和碟子 B 的参数不再发生变化为止。
实际我们遇到的问题,比分菜复杂。我再给你举个一个投掷硬币的例子,假设我们有 A 和 B 两枚硬币,我们做了 5 组实验,每组实验投掷 10 次,然后统计出现正面的次数,实验结果如下:
投掷硬币这个过程中存在隐含的数据,即我们事先并不知道每次投掷的硬币是 A 还是 B。假设我们知道这个隐含的数据,并将它完善,可以得到下面的结果:
我们现在想要求得硬币 A 和 B 出现正面次数的概率,可以直接求得:
而实际情况是我不知道每次投掷的硬币是 A 还是 B,那么如何求得硬币 A 和硬币 B 出现正面的概率呢?
这里就需要采用 EM 算法的思想。
初始化参数。我们假设硬币 A 和 B 的正面概率(随机指定)是θA=0.5 和θB=0.9。
计算期望值。假设实验 1 投掷的是硬币 A,那么正面次数为 5 的概率为:
公式中的 C(10,5) 代表的是 10 个里面取 5 个的组合方式,也就是排列组合公式,0.5 的 5 次方乘以 0.5 的 5 次方代表的是其中一次为 5 次为正面,5 次为反面的概率,然后再乘以 C(10,5) 等于正面次数为 5 的概率。
假设实验 1 是投掷的硬币 B ,那么正面次数为 5 的概率为:
所以实验 1 更有可能投掷的是硬币 A。
然后我们对实验 2~5 重复上面的计算过程,可以推理出来硬币顺序应该是{A,A,B,B,A}。
这个过程实际上是通过假设的参数来估计未知参数,即“每次投掷是哪枚硬币”。
- 通过猜测的结果{A, A, B, B, A}来完善初始化的参数θA 和θB。
然后一直重复第二步和第三步,直到参数不再发生变化。
简单总结下上面的步骤,你能看出 EM 算法中的 E 步骤就是通过旧的参数来计算隐藏变量。然后在 M 步骤中,通过得到的隐藏变量的结果来重新估计参数。直到参数不再发生变化,得到我们想要的结果。
EM 聚类的工作原理
上面你能看到 EM 算法最直接的应用就是求参数估计。如果我们把潜在类别当做隐藏变量,样本看做观察值,就可以把聚类问题转化为参数估计问题。这也就是 EM 聚类的原理。
相比于 K-Means 算法,EM 聚类更加灵活,比如下面这两种情况,K-Means 会得到下面的聚类结果。
因为 K-Means 是通过距离来区分样本之间的差别的,且每个样本在计算的时候只能属于一个分类,称之为是硬聚类算法。而 EM 聚类在求解的过程中,实际上每个样本都有一定的概率和每个聚类相关,叫做软聚类算法。
你可以把 EM 算法理解成为是一个框架,在这个框架中可以采用不同的模型来用 EM 进行求解。常用的 EM 聚类有 GMM 高斯混合模型和 HMM 隐马尔科夫模型。GMM(高斯混合模型)聚类就是 EM 聚类的一种。比如上面这两个图,可以采用 GMM 来进行聚类。
和 K-Means 一样,我们事先知道聚类的个数,但是不知道每个样本分别属于哪一类。通常,我们可以假设样本是符合高斯分布的(也就是正态分布)。每个高斯分布都属于这个模型的组成部分(component),要分成 K 类就相当于是 K 个组成部分。这样我们可以先初始化每个组成部分的高斯分布的参数,然后再看来每个样本是属于哪个组成部分。这也就是 E 步骤。
再通过得到的这些隐含变量结果,反过来求每个组成部分高斯分布的参数,即 M 步骤。反复 EM 步骤,直到每个组成部分的高斯分布参数不变为止。
这样也就相当于将样本按照 GMM 模型进行了 EM 聚类。
如何使用 EM 工具包
在 Python 中有第三方的 EM 算法工具包。由于 EM 算法是一个聚类框架,所以你需要明确你要用的具体算法,比如是采用 GMM 高斯混合模型,还是 HMM 隐马尔科夫模型。
from sklearn.mixture import GaussianMixture
我们看下如何在 sklearn 中创建 GMM 聚类。
首先我们使用 gmm = GaussianMixture(n_components=1, covariance_type=‘full’, max_iter=100) 来创建 GMM 聚类,其中有几个比较主要的参数(GMM 类的构造参数比较多,我筛选了一些主要的进行讲解),我分别来讲解下:
1.n_components:即高斯混合模型的个数,也就是我们要聚类的个数,默认值为 1。如果你不指定 n_components,最终的聚类结果都会为同一个值。
2.covariance_type:代表协方差类型。一个高斯混合模型的分布是由均值向量和协方差矩阵决定的,所以协方差的类型也代表了不同的高斯混合模型的特征。协方差类型有 4 种取值:
- covariance_type=full,代表完全协方差,也就是元素都不为 0;
- covariance_type=tied,代表相同的完全协方差;
- covariance_type=diag,代表对角协方差,也就是对角不为 0,其余为 0;
- covariance_type=spherical,代表球面协方差,非对角为 0,对角完全相同,呈现球面的特性。
3.max_iter:代表最大迭代次数,EM 算法是由 E 步和 M 步迭代求得最终的模型参数,这里可以指定最大迭代次数,默认值为 100。
创建完 GMM 聚类器之后,我们就可以传入数据让它进行迭代拟合。
我们使用 fit 函数,传入样本特征矩阵,模型会自动生成聚类器,然后使用 prediction=gmm.predict(data) 来对数据进行聚类,传入你想进行聚类的数据,可以得到聚类结果 prediction。
你能看出来拟合训练和预测可以传入相同的特征矩阵,这是因为聚类是无监督学习,你不需要事先指定聚类的结果,也无法基于先验的结果经验来进行学习。只要在训练过程中传入特征值矩阵,机器就会按照特征值矩阵生成聚类器,然后就可以使用这个聚类器进行聚类了。
如何用 EM 算法对王者荣耀数据进行聚类
了解了 GMM 聚类工具之后,我们看下如何对王者荣耀的英雄数据进行聚类。
首先我们知道聚类的原理是“人以群分,物以类聚”。通过聚类算法把特征值相近的数据归为一类,不同类之间的差异较大,这样就可以对原始数据进行降维。通过分成几个组(簇),来研究每个组之间的特性。或者我们也可以把组(簇)的数量适当提升,这样就可以找到可以互相替换的英雄,比如你的对手选择了你擅长的英雄之后,你可以选择另一个英雄作为备选。
我们先看下数据长什么样子:
这里我们收集了 69 名英雄的 20 个特征属性,这些属性分别是最大生命、生命成长、初始生命、最大法力、法力成长、初始法力、最高物攻、物攻成长、初始物攻、最大物防、物防成长、初始物防、最大每 5 秒回血、每 5 秒回血成长、初始每 5 秒回血、最大每 5 秒回蓝、每 5 秒回蓝成长、初始每 5 秒回蓝、最大攻速和攻击范围等。
具体的数据集你可以在 GitHub 上下载:https://github.com/cystanford/EM_data。
现在我们需要对王者荣耀的英雄数据进行聚类,我们先设定项目的执行流程:
- 首先我们需要加载数据源;
- 在准备阶段,我们需要对数据进行探索,包括采用数据可视化技术,让我们对英雄属性以及这些属性之间的关系理解更加深刻,然后对数据质量进行评估,是否进行数据清洗,最后进行特征选择方便后续的聚类算法;
- 聚类阶段:选择适合的聚类模型,这里我们采用 GMM 高斯混合模型进行聚类,并输出聚类结果,对结果进行分析。
按照上面的步骤,我们来编写下代码。完整的代码如下:
# -*- coding: utf-8 -*-
import pandas as pd
import csv
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
from sklearn.mixture import GaussianMixture
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 数据加载,避免中文乱码问题
data_ori = pd.read_csv('./heros7.csv', encoding = 'gb18030')
features = [u'最大生命',u'生命成长',u'初始生命',u'最大法力', u'法力成长',u'初始法力',u'最高物攻',u'物攻成长',u'初始物攻',u'最大物防',u'物防成长',u'初始物防', u'最大每 5 秒回血', u'每 5 秒回血成长', u'初始每 5 秒回血', u'最大每 5 秒回蓝', u'每 5 秒回蓝成长', u'初始每 5 秒回蓝', u'最大攻速', u'攻击范围']
data = data_ori[features]
# 对英雄属性之间的关系进行可视化分析
# 设置 plt 正确显示中文
plt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei'] # 用来正常显示中文标签
plt.rcParams['axes.unicode_minus']=False # 用来正常显示负号
# 用热力图呈现 features_mean 字段之间的相关性
corr = data[features].corr()
plt.figure(figsize=(14,14))
# annot=True 显示每个方格的数据
sns.heatmap(corr, annot=True)
plt.show()
# 相关性大的属性保留一个,因此可以对属性进行降维
features_remain = [u'最大生命', u'初始生命', u'最大法力', u'最高物攻', u'初始物攻', u'最大物防', u'初始物防', u'最大每 5 秒回血', u'最大每 5 秒回蓝', u'初始每 5 秒回蓝', u'最大攻速', u'攻击范围']
data = data_ori[features_remain]
data[u'最大攻速'] = data[u'最大攻速'].apply(lambda x: float(x.strip('%'))/100)
data[u'攻击范围']=data[u'攻击范围'].map({'远程':1,'近战':0})
# 采用 Z-Score 规范化数据,保证每个特征维度的数据均值为 0,方差为 1
ss = StandardScaler()
data = ss.fit_transform(data)
# 构造 GMM 聚类
gmm = GaussianMixture(n_components=30, covariance_type='full')
gmm.fit(data)
# 训练数据
prediction = gmm.predict(data)
print(prediction)
# 将分组结果输出到 CSV 文件中
data_ori.insert(0, '分组', prediction)
data_ori.to_csv('./hero_out.csv', index=False, sep=',')
运行结果如下:
[28 14 8 9 5 5 15 8 3 14 18 14 9 7 16 18 13 3 5 4 19 12 4 12
12 12 4 17 24 2 7 2 2 24 2 2 24 6 20 22 22 24 24 2 2 22 14 20
14 24 26 29 27 25 25 28 11 1 23 5 11 0 10 28 21 29 29 29 17]
同时你也能看到输出的聚类结果文件 hero_out.csv(它保存在你本地运行的文件夹里,程序会自动输出这个文件,你可以自己看下)。
关于引用包
首先我们会用 DataFrame 数据结构来保存读取的数据,最后的聚类结果会写入到 CSV 文件中,因此会用到 pandas 和 CSV 工具包。另外我们需要对数据进行可视化,采用热力图展现属性之间的相关性,这里会用到 matplotlib.pyplot 和 seaborn 工具包。在数据规范化中我们使用到了 Z-Score 规范化,用到了 StandardScaler 类,最后我们还会用到 sklearn 中的 GaussianMixture 类进行聚类。
数据可视化的探索
你能看到我们将 20 个英雄属性之间的关系用热力图呈现了出来,中间的数字代表两个属性之间的关系系数,最大值为 1,代表完全正相关,关系系数越大代表相关性越大。从图中你能看出来“最大生命”“生命成长”和“初始生命”这三个属性的相关性大,我们只需要保留一个属性即可。同理我们也可以对其他相关性大的属性进行筛选,保留一个。你在代码中可以看到,我用 features_remain 数组保留了特征选择的属性,这样就将原本的 20 个属性降维到了 13 个属性。
关于数据规范化
我们能看到“最大攻速”这个属性值是百分数,不适合做矩阵运算,因此我们需要将百分数转化为小数。我们也看到“攻击范围”这个字段的取值为远程或者近战,也不适合矩阵运算,我们将取值做个映射,用 1 代表远程,0 代表近战。然后采用 Z-Score 规范化,对特征矩阵进行规范化。
在聚类阶段
我们采用了 GMM 高斯混合模型,并将结果输出到 CSV 文件中。
这里我将输出的结果截取了一段(设置聚类个数为 30):
第一列代表的是分组(簇),我们能看到张飞、程咬金分到了一组,牛魔、白起是一组,老夫子自己是一组,达摩、典韦是一组。聚类的特点是相同类别之间的属性值相近,不同类别的属性值差异大。因此如果你擅长用典韦这个英雄,不防试试达摩这个英雄。同样你也可以在张飞和程咬金中进行切换。这样就算你的英雄被别人选中了,你依然可以有备选的英雄可以使用。
聚类和分类不一样,聚类是无监督的学习方式,也就是我们没有实际的结果可以进行比对,所以聚类的结果评估不像分类准确率一样直观,那么有没有聚类结果的评估方式呢?这里我们可以采用 Calinski-Harabaz 指标,代码如下:
from sklearn.metrics import calinski_harabaz_score
print(calinski_harabaz_score(data, prediction))
指标分数越高,代表聚类效果越好,也就是相同类中的差异性小,不同类之间的差异性大。当然具体聚类的结果含义,我们需要人工来分析,也就是当这些数据被分成不同的类别之后,具体每个类表代表的含义。
另外聚类算法也可以作为其他数据挖掘算法的预处理阶段,这样我们就可以将数据进行降维了。